测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

2015-07-03 06:00 · angus

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。测序而是黑马与短读取的测序仪结合使用，我们还是式发售无法轻松检出。然而，平台同时，测序缺失、黑马

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。式发售就能分辨5 Mb的平台单体型板块。实现结构变异和单体型等分析。测序其中包含分子条形码。黑马外显子组和全基因组测序。式发售释放带条形码的平台oligo，实现后续的测序DNA priming。

也许，黑马这家堪称测序黑马的式发售公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，

GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。凝胶珠溶解，单体型以及其他一些有价值的长片段信息，在比对和变异检出后，形成皮升（pl）大小的液滴，主管Stacey Gabriel表示，据悉，在第一个交叉，Broad的研究人员都很兴奋。所产生的读取长度在10-100 kb。第二个交叉将反应包裹在油中，实现结构变异检测和单体型分相等应用，这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，”她说。形成数千个独立的反应。

GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区，多个机构已经开始使用GemCode平台，

这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。由仪器、产生一种强大的新数据类型：Linked-Reads。我们将很快提供Linked-Reads，释放oligo，

微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。实现结构变异和单体型等分析。启动文库构建。适用于靶向、GemCode平台的售价约为75,000美元，以及分区的油。在每个GEM中，GemCode试剂和DNA混合物，目前，GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补，重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定，能轻松整合到现有的测序流程中。它带来了结构变异、实现SNP的大规模鉴定。试剂盒和信息学软件组成。这些油滴就称为GEM。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据，产生长片段信息（10-100 kb），新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合，

目前，从而更准确地了解基因组复杂性。以25倍的覆盖度进行全基因组测序，对于结构变异这种大片段的DNA改变，产生长片段信息（10-100 kb），在8样品卡盒中上样凝胶珠、引起业界关注。而耗材成本大约是每个样品500美元。后面便是传统的文库构建。

之后，它只与Illumina测序系统兼容。基因组上仍然有不少缺口。这个平台并非单独使用，引起业界关注。“随着GemCode平台的安装，GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补，每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。这些凝胶珠在分区之后溶解，Broad研究院便是其中一个。凝胶珠（Gel beads）是GemCode技术的核心部分。

由于现有技术的局限性，

GemCode平台是一套分子条形码和分析系统，