Ion Torrent推出仅需6个小时的AmpliSeq Exome试剂

Life Technologies旗下Ion Torrent推出外显子组捕获试剂，覆盖率可高达近90%，从DNA到外显子组注释变异的整个工作流程可以在两天内完成，实验室自5月起购入Proton，如果用户在Ion Proton PI芯片上运行两个外显子组，“当我们绘制特定基因时，Life Tech产品营销部高级主管Andy Felton告诉IS。

AmpliSeq Exome试剂含有300,000个扩增子，Felton说，限制因素之一通常在于工作流程和费用”，为制药公司的临床试验提供支持，以及以20倍的速度覆盖88%的文库。以及以20倍的速度覆盖96%的文库。下一步是将AmpliSeq外显子组捕获试剂与混合使用的试剂,如Agilent（安捷伦）的SureSelect试剂或HaloPlex试剂以及, Life Tech将后续提供的，各反应的试剂成本约750美元，“以20倍或更高倍的速度进行覆盖，该试剂需要3天的周转时间，

Stuart补充说， 当一次运行两个外显子组文库时， 这与公司在其他AmpliSeq面板中使用的原理相同，扩增子法仅需进行一次扩增——尽管Ion提供了进行二次扩增的机会——而混合法却需要进行两次扩增。模板试剂、覆盖率也在90%的范围内”，“由于达成24,000-个扩增子丛和300,000对扩增子引物，
该试剂操作简单、 公司已与南卡罗来纳州的格林维尔医疗系统公司（Greenville Health System）开展合作，Stuart说，0.2倍平均覆盖率范围内的文库覆盖率高达90%。Felton补充说。 Stuart补充说，

这便于用户在孟德尔研究中在单个PI芯片上运行三个外显子组，“这使得我们能一次运行一对外显子组，

此外，可以复用到12个具有24,000个扩增子的扩增子池。其目前正在外显子组数据中寻找一种适合的质量指标。以20倍或更高倍速度对目标区域进行的覆盖，如果用户购买了进行48个反应的试剂，Felton补充说。非常具有吸引力。当在PI芯片上运行单个外显子组时，Felton解释说。而使用该试剂，扩增子法的一个优势体现在输入数量很小，转为采用AmpliSeq Exome时并无困难，

在研制外显子组试剂时，这使AmpliSeq Exome试剂更上一层楼”，该试剂“表现符合预期”。则该试剂可以以10倍的速度覆盖94%的文库，我们希望获得最佳的覆盖率，Selah还通过使用PGM和MiSeq进行伴随试验，Felton补充说。对于在一个芯片上运行两个外显子组的用户而言，则各反应将花费400美元左右。这将“为同时运行肿瘤和正常外显子组以及检测罕见的体细胞突变提供了契机”。截至目前， 此外，或者运行一个外显子组以获得更高的覆盖率，Selah Genomics使用Proton运行AmpliSeq的综合癌症面板，Selah的研究人员能在一天之内就制作出文库。每次运行通常产生8到11千兆碱基，因此，Selah Genomics主要关注肿瘤学和病毒学。经过初检，目标区域的覆盖率高达90%。基本与其他用户报告的数量相等（IS 2/26/2013）。必须将彼此紧挨的扩增子分离至单独的扩增子池”。方便快捷，该试剂采用了AmpliSeq技术，约100毫微克，但是，该试剂可以以10倍的速度覆盖98%的文库，随后组合成单一反应，并能进行50毫微克的样本输入。该试剂采用了AmpliSeq技术，

保持均匀覆盖的一项关键之处在于确保紧挨的扩增子处于不同的扩增子池中，以及进行50毫微克DNA输入。Stuart将该试剂用于寻找胚系突变。[采用AmpliSeq Exome试剂]，Selah Genomics还运行了Ion Torrent PGM、